启德书院党总支是启德书院开展党建工作的领导者与决策者，负责宣传和执行党的路线、方针、政策，宣传和执行党中央、上级组织和本组织的决议，充分发挥党员的先锋模范作用；组织党员认真学习马列主义、毛泽东思想，学习建设有中国特色社会主义的理论和党的路线、方针、政策及决议，学习党的基本知识，学习科学文化和业务知识；对党员进行教育、管理和监督，提高党员素质，增强党性，开展党组织生活；密切联系群众，经常了解群众对党员、党的工作批评和意见，维护群众的正当权利和利益，做好群众的思想工作。同时肩负着发展党员、引导团支部进行组织生活等重任。启德书院党总支委员会现由副书记以及五个总支委员组成，下设九个学生党支部。